Hiện nay có một trường cùng tên là Trường Đại học Tài chính - Kế toán có trụ sở tại Quảng Ngãi. Trường cũng trực thuộc Bộ Tài chính, tuy nhiên có lịch sử hình thành và phát triển độc lập với trường Đại học Tài chính - Kế toán có trụ sở tại Hà Nội.

Trường tại Hà Nội thành lập năm 1976 trên cơ sở nâng cấp từ Trường Cán bộ Tài chính kế toán Ngân hàng Trung ương, trước đó là Trường Cán bộ Tài chính - Kế toán Trung ương thành lập từ 1963. Trường đã đào tạo bậc đại học từ năm 1976. Đến năm 1988 thì đổi tên thành Trường Đại học Tài chính - Kế toán Hà Nội (nay là Học viện Tài chính - sáp nhập và nâng cấp năm 2001) và nâng cấp cơ sở II tại Thành phố Hồ Chí Minh thành Trường Đại học Tài chính - Kế toán Thành phố Hồ Chí Minh (nay là Trường Đại học Kinh tế Thành phố Hồ Chí Minh - sáp nhập thành Trường Đại học Kinh tế trực thuộc Đại học Quốc gia Thành phố Hồ Chí Minh năm 1996 và trở thành trường độc lập từ năm 2000).

Trường tại Quảng Ngãi thành lập năm 1976, ban đầu là Trường Trung học Tài chính Kế toán III, trở thành Trường Cao đẳng Tài chính - Kế toán Quảng Ngãi năm 1997 và nâng cấp thành Trường Đại học Tài chính - Kế toán năm 2011.